Intraspecifična karakterizacija izolata Vibrio alginolyticus prikupljenih iz sustava akvakulture i morskih biotopa u Tunisu korištenjem PCR-RFLP, ECP i OMPS profiliranja.

Sažetak

     Ukupno 54 vjerojatna soja Vibrio alginolyticus izolirana su iz raznih morskih biotopa u Tunisu, iz morske vode i sedimenta s nekoliko kupališta i uzgajališta te su karakterizirani i identificirani pomoću nekoliko biokemijskih testova. Istraživana je prikladnost metoda kao što su analiza polimorfizma duljine restrikcijskih fragmenata PCR proizvoda (PCR-RFLP), profiliranje izvanstaničnih proizvoda (ECP) i proteina vanjske membrane (OMP) kao alata za istraživanje raznolikosti Vibrio alginolyticus unutar ove složene skupine. Rezultati su pokazali da postoji velika heterogenost u raznolikosti određenoj metodom PCR-RFLP koja se odnosila na broj genotipova generiranih s dva testirana enzima SduI i FaqI. Ova heterogenost je uočena ne samo prema podrijetlu (morska voda, sediment, uzgajališta riba i školjkaša), već i unutar istog tipa uzorka. Druge dvije metode, ECP i OMP rezultirale su s 32, odnosno 26 profila. Indeks diskriminacije utvrđen u ovoj studiji istaknuo je dobru sposobnost PCR-RFLP metode u razlikovanju sličnih sojeva V. alginolyticus.